A esofagoscopia é útil no diagnóstico de doenças esofágicas, que incluem esofagite, corpos estranhos esofágicos, bem como no diagnóstico de câncer de esôfago.  

A gastroduodenoscopia refere-se a um exame da superfície interna do estômago e da porção inicial do intestino delgado (duodeno) usando um endoscópio de fibra óptica flexível. Além da inspeção visual, a gastroduodenoscopia oferece a capacidade de obter várias biópsias do revestimento do intestino delgado e do estômago.  A gastroduodenoscopia, portanto, fornece uma excelente ferramenta no diagnóstico de vários distúrbios do sistema intestinal. Embora a anestesia geral seja necessária, a gastroduodenoscopia geralmente é um procedimento seguro, não cirúrgico e indolor. A maioria dos pacientes recebe alta no mesmo dia em que o procedimento é realizado.

Os principais sintomas e razões para realizar uma gastroduodenoscopia são:

1. Vômitos persistentes

2. Perda de peso persistente devido a um distúrbio do intestino delgado

3. Fezes pretas e alcatroadas (melena persistente)

4. Diarreia crônica devido a um distúrbio do intestino delgado

5. Vômito de sangue

6. Possível obstrução estomacal ou intestinal

7. Incapacidade de mastigar ou engolir normalmente (disfagia)

8. Remoção de matéria estranha do estômago ou esôfago

9. Colocação de um tubo de alimentação

A colonoscopia é realizada após uma investigação diagnóstica completa e plano terapêutico

não conseguiram resolver os problemas ligados ao intestino grosso. Para realizar a colonoscopia,

o paciente é anestesiado e um endoscópio de fibra óptica flexível é introduzido no cólon.  O ar, passado pelo escopo, aumenta a visão dentro dos dois pontos. As biópsias podem ser obtidas passando um instrumento através de uma abertura no escopo. A colonoscopia fornece um meio valioso e não cirúrgico para diagnosticar distúrbios do intestino grosso. Para realizar a colonoscopia, é importante que o cólon esteja limpo de matéria fecal para que a superfície do cólon possa ser visualizada.  Isso geralmente requer a retenção de alimentos por 24 a 48 horas e dar ao seu animal de estimação uma solução para beber que 'limpa' o cólon. Enemas de água morna também podem ser usados para limpar o cólon. A maioria dos pacientes recebe alta no mesmo dia do procedimento.

Os principais sintomas e razões para realizar uma colonoscopia são:

1. Diarreia crônica

2. Sangue nas fezes (hematoquezia persistente)

3. Estudo de um crescimento no cólon ou reto

4. Esforço durante a defecação (tenesmo persistente)

5. Excesso de muco nas fezes

6. Fezes de tamanho significativamente diminuído ou estreitado

Mais recentemente, a colonoscopia tem desempenhado um papel importante em problemas intestinais superiores, como perda de peso, diarreia crônica e vômitos. Neste caso, o objetivo da colonoscopia é obter biópsias do íleo. Isso é especialmente importante em gatos, pois acredita-se que até 40% dos gatos com linfoma intestinal só terão evidências de linfoma no íleo.  

Por fim, a colonoscopia pode ser usada para diagnosticar e dilatar estenoses retais, bem como para remover pólipos colônicos que não são excisáveis cirurgicamente.